Franz Rupaner übersiedelte als Kind mit seinen Eltern nach Wien, legte 1960 die Externistenmatura ab und studierte zwei Semester Rechtswissenschaften. Ab 1960 war er als Verwaltungsbeamter in verschiedenen Abteilungen des Magistrats beschäftigt.

Rupaner, der seit seiner Jugend Mitglied der sozialdemokratischen Bewegung war, engagierte sich in der SPÖ-Meidling, war von 1981 bis 1988 Mitglied der Bezirksvertretung, danach bis 1991 Gemeinderat und Landtagsabgeordneter und wurde 1991 als Nachfolger Kurt Neigers zum Bezirksvorsteher von Meidling gewählt (bis 1995).